《末日孤舰》是一部改编自威廉姆·布林克利同名小说的美国末日题材科幻电视剧。一种传染力极强且致死率极高的瘟疫席卷全球，造成全球80%的人口死亡，各国政府陷入瘫痪，只有单独在北极圈内执行为期四个月任务的美国海军导弹驱逐舰内森·詹姆斯号（USS Nathan James）未受到影响。直到遭受到俄军袭击后，舰上的人员才发现原来随行的两名病毒学者的机密任务是收集造成瘟疫的的原始病毒株，借此开发疫苗挽救人类。于是船员必须与舰上的两名病毒学者Rachel Scott博士和Quincy Tophet博士配合，找出治愈瘟疫的方法来阻止这场人类浩劫......