《慢树懒六六》是一部关于友情、勇气和适应的故事。第二季在原有的三条故事主线基础上新增部分配角的内容，让主角以及配角的角色设定更加丰富和多样化。第一条故事主线围绕树懒六六展开，除了六六与另外两个小伙伴在树屋中发生的日常故事外，新增了倒霉的小偷、意外相遇的瓢虫、被吉仔带回家的小依等角色与六六产生新的交集；第二条故事主线则是关于食蚁兽吉仔的职场生活，除了吉仔的职场故事外，新增灭虫公司其他员工的工作日常，让吉仔的同事角色更加丰满；第三条故事主线则是犰狳阿来的便利店打工生活，在这条故事线中新增了一位性格迥异的三明治店长，吉仔顶替阿来打工，在临期食物争夺上遇到势均力敌的对手犀牛，倒霉的小偷与三明治老板相遇的有趣故事。