本剧是以杜心武传奇故事为题材创作的一部言情动作剧，全剧充满了强烈的民族意识和爱国精神。 该剧介绍了神秘莫测的“自然门”武功传人—杜心武。为了好友谭嗣同的牺牲毅然独闯紫禁城，刹杀误国秧民的慈嬉太后，而遭到清廷追辑被迫逃亡日本并结识了孙中山等革命志士，从此投身革命，成为孙中山的保镖，共同奔走海内外，鼓动革命。为了保护革命经费，他击败日本武术第一高手，为了推翻腐败的满清政府，他随宋教仁先后收服了东北马贼，策反新军，打响了武昌革命第一枪。为了维护共和，他不惜冒生命危险，刹杀妄想恢复帝制的袁世凯，这些脍炙人口的英雄事迹，永远为后人传颂。
何奇通（郭蔼明 饰）是“奇通私家侦探社”的负责人，在一次帮助一名女子搜集她的警察丈夫出轨的证据时，与警察耀祖（郭晋安 饰）相遇了。耀祖处处帮助同事掩饰婚外情，令到奇通对他这种臭男人十分讨厌，认为他也是一路货色。奇通的父亲在她小时候就是因婚外情出走，留下母亲郁郁而终，而奇通也只得在侦探社负责人德叔（秦沛 饰）的照料下长大，所以奇通生平最痛恨出轨的男人。终于奇通完成了任务搜集够了证据，却与耀祖结下了梁子。随后，奇通重遇了中学好友宝怡（汤宝如 饰），更得知宝怡竟是耀祖女友，奇通处处提醒宝怡要提防耀祖，更教她跟踪术，搞得耀祖不胜其烦。一次耀祖因工作需要出入色情场所被奇通拍下了照片，阿怡拿着照片想耀祖质问，令耀祖工作受到了影响，自此他更是讨厌奇通。 随后阿怡怀上了身孕，准备和耀祖结婚，岂料结婚当日阿怡却突然失踪了。深爱阿怡的耀祖四出寻找，最后因旷工多日被开除出警队。奇通可怜耀祖，觉得自己对他搞成这样也负有一定责任，于是通过德叔邀请耀祖加入他们的侦探社，耀祖一方面想找回未婚妻，一方面迫于生活压力，最终加入了侦探社。于是，他们开始了一段又一段情事缉私档案。
继续展现ICAC如何锲而不舍，打击层出不穷的贪污舞弊罪行，不让繁荣稳定的香港因一小撮人而负上沉重的代价。《廉政行动二○○四》分为五个单元剧，分别是由贩卖外国护照改编的“终极斗智”、由解款车走私案改编的“不一样的赌注”、改编自首宗因身为公职人员行为不当而犯罪的“以权谋私”、廉署同一时间调查两宗涉及税务贪污案件的“猎户天龙”，以及综合所有公营房屋短桩案而成的“短桩”。
