中医药大学教授任新正（吴刚 饰）致力于广传中医，他辞职创办中医传承班，希望培养出真正能将中医之道传承下去的接班人。混不吝孙头头（赵露思 饰）也意外加入师承班，与任新正的儿子任天真（罗一舟 饰）水火不容，与律师转行的杨小红（张萌 饰）、三甲医院儿科医生彭十堰（周澄奥 饰）、背负全村的期望想成为名医的赵力权（朱俊麟 饰）等一众学生也是格格不入。 这群带着各自疑问而来的学生，跟着发大愿的任新正、宋灵兰（江珊 饰）等师长，在一地鸡毛中向着传承道统的方向砥砺前行，以后浪之姿学习传承中医传统文化。
乾隆年间红花会崛起企图推翻满清统治红花会总航主于万亭偷入禁宫告以乾隆（郑少秋）本乃汉人之身世乾隆为安全计杀于灭口于之义子陈家洛乃乾隆胞弟于死后接任为总舵主继承反清复汉大业陈得悉乾隆出游江南乃与文泰来（朱江）、骆冰（李司祺）余鱼同（夏雨）等十四当家齐赴杭州得用名妓玉如意（狄波拉）之美色引乾隆至六和塔痛陈利害逼乾隆与红花会合作共谋反清陈回疆认识霍青桐二人暗生情愫后因李浣芷（黄淑仪）女扮男装与桐态度亲密陈误以为枫叶心有所属失意万分陈替乾隆取回身世证物之时遇香香公主两人一见钟情互订终生后得悉香乃桐之妹又得知误会了枫叶因苦不已乾隆因迷恋者派张召重（石坚）掳香入宫逼为妃妾时陈已取证物回嘱乾隆遵守诺言乾隆因受制于太后复知香对陈痴心乃背信弃盟设宴雍和宫欲将红花会一网打尽结果如何剧中自有分晓。
受人尊敬的正义法官秦誉（张家辉饰），为掩盖儿子交通肇事逃逸真相，不惜将自己拖入罪恶深渊，在法官职责与父亲身份间陷入两难，高级督察唐萱（胡杏儿饰）在调查中发现端倪，逐步揭开案件背后隐藏的父爱牺牲与程序正义的冲突，一场关于父爱与正义的终极博弈就此展开。
在第二部里，包拯（陆毅 饰）已经褪去了初生牛犊不怕虎的生涩和冲动，而成了稳重有担待的县城父母官，偏安一隅为民请命。这天收到皇上急召回京，查办收受贿赂贪污的官员接连连续死亡的案件。少年包青天再次出动，而沿路上在各个案件里遇见的王朝马汉、张龙赵虎，日后都会是我们熟悉的大名鼎鼎的包公身边的护卫人物。公孙策（任泉 饰）已然拜服在包拯的聪明才智下，甘愿辅佐他办案。这次遇见的姑娘的是惯偷小蜻蜓（范冰冰 饰），活泼捣蛋的她一直身份神秘，直到案件去到大画家冯止水事件，大家才明白小蜻蜓的身世悲惨：收养她的义父自小视他如己出，为她亲笔作画《牡丹亭上的少女》，内藏一秘密。后来失踪于江湖再无音信，多年来小蜻蜓用尽办法找寻义父下落皆无消息，这次唯有希望包拯能查出事情真相。
