《监狱学院》讲述了东京郊外的私立八光学园的故事，这所为了培养大小姐的贵族学校从公元2011年4月开始正式改为了男女合校，首批入学的男子有五个人。 他们并不是全员都帅得一塌糊涂能够迷倒众生，甚至相貌属于很不起眼的类型。在身处周围1000位女生的女校范围内，这些男人能够克制住自己蓬勃的青春欲望 吗？主人公藤野清志等人的命运究竟如何呢？