该剧改编自步月浅妆的小说《权宠之仵作医妃》，讲述大理寺卿沈毅因卷入晋王案，全家惨遭灭门，其女沈莞借用秦府九娘子秦莞的身份逃到荆州。原本柔弱可欺的秦莞“性情大变”，不仅会治病救人，还能剖尸探案，顺带将秦府的伯母庶妹姨娘刁奴治得服服帖帖。探案期间秦结识了睿王世子燕迟，燕迟一心为晋王翻案，与秦莞为父昭雪的目标不谋而合，二人一起回京，途中联手破获了各式诡谲大案。回京后，一具意外发现的骸骨让晋王案得以重提，燕迟和秦莞一起慢慢接近了案件的真相，发现了皇宫里深藏的惊天秘密。
面对日益严重的罪案，香港警方的组织日趋强大和现代化，警方人员的质素亦不断提高。十三集警匪单元剧「干探群英」便是描写警队中心的一组干探，在他们面对悍匪时，亦有自身的喜怒哀乐，从中揭示他们的查案经过及生活情况。 新任帮办欧阳锦源（关礼杰）是一学院派出身的年轻人，他初入重案组，与性格火爆的探员炸弹（甄子丹）、滋油淡定的甘旺（李成昌）格格不入，时有冲突，但在辑拿悍匪丁木（欧瑞伟）的事件中，三人发展出惺惺相惜，英雄重英雄的同胞之爱。 女警方静敏（何嘉丽）外刚内柔，对炸弹的粗豪性格初时颇不以为然，但对其颐指气使却逆来顺受，某次两人终于大打出手，自此以后，二人竟踏上爱情之路。 而干探们在屡建大功之余，在感情方面亦有进展及变化，锦源与女友分手；甘旺在一次收保护费的案中与前女友玲（商天娥）重拾旧欢。众人又对警署餐厅老板女儿Flora（刘玉翠）极尽关怀爱护，令她从罪恶边缘重回父亲怀抱。 最后，炸弹在一次捉拿大毒犯案中，揭发一段家庭恩怨，原来其契爷（王伟）不但是大毒枭，更是其杀父仇人！究竟炸弹能否逮捕其契爷？而众人在爱情路上是否如意？
谢颖之的离开让张伟杰（梁朝伟 饰）深受打击，封闭起了内心，不愿意再结识新的伴侣。期间，叔父张竟成（周润发 饰）从大陆来到香港，叔侄两人之间建立起了深厚的友谊。一次偶然中，张伟杰认识了名为巧宣（曾华倩 饰）的女孩，巧宣的温柔和善良融化了张伟杰内心的坚冰，两人渐渐走到一起，最终携手步入了婚姻的殿堂。 然而，随着时间的推移，最初热切的激情慢慢冷却，久而久之，张伟杰竟然和巧宣的好友吴欣产生了一段不道德的恋情。在一宗谋杀案里，吴欣不幸的成为了受害者死于非命，这起案件将巧宣和张伟杰也牵扯了进去。
美丽的女孩梅云（孙菲菲 饰）是上海药业大亨梅雨亭的爱女，虽出身富庶家庭，但是她胸怀崇高理想与情操，志愿投身革命事业。为此，她不惜抛弃养尊处优的生活，拉着姐姐梅兰和佣人阿牛追随新四军的脚步。梅氏姐妹经历了难以想象的磨练，最终梅兰不堪忍受，回到家中，与心怀叵测的汪伪政府特务头子沈子鹤结为夫妇。而梅云留在新四军中，渐渐喜欢上了一向讨厌的江南独立大队队长凌永达（焦恩俊 饰），同时渐渐成长为一个出色的特工。在首长的授意下，梅云假意脱离革命，潜入汪伪政府搜集情报。在此过程中，她的生命、信仰和爱情皆经受着巨大而严苛的考验……
