表面看来，薛丹仁（李思捷 饰）只是一介普通警员，可实际上，他在玄学方面颇有造诣，并将其灵活运用，因此而破获了诸多让同行们头痛不已的谜案，再加上一个神通广大的好友梁醒裘（梁烈唯 饰）出手相助，令薛丹仁在业界获得了良好的口碑，甚至引起了上司车季菲（万绮雯 饰）的注意。 车季菲学习犯罪心理学出生，对待事情习惯理性当先，同薛丹仁大相径庭，然而，两人之间却产生了意外的默契。城中频发的连环失踪案让市民们陷入了恐慌之中，扑朔迷离的案情令车季菲十分困惑，让她没有想到的是，这起案件竟然同薛丹那不为人知的过往有着千丝万缕的关联。
故事发生在南宋末年，郭靖（张智霖 饰）和杨康（罗嘉良 饰）分别是郭家和杨家最后的传人，郭靖生长于大漠之中，受高人指点研习武艺，为人忠厚正直，而杨康则被金人完颜洪烈（王伟 饰）收养，成为了太子。 某日，郭靖南下，结识了名为黄蓉（朱茵 饰）的伶俐女子，随着时间的推移，两人之间情愫渐生，渐渐走到了一起。与此同时，郭靖更得到了北丐洪七公（刘丹 饰）和周伯通（黎耀祥 饰）的指点，分别习得了江湖失传已久的降龙十八掌及九阴真经。一次意外中，杨康得知了完颜洪烈正是自己的杀父仇人，然而，在利益的驱使下，他认贼作父，更联合邪恶的西毒欧阳锋（朱铁和 饰），企图从郭靖手上夺取武林秘籍。
少林寺乃江湖武术宗师所在地，清朝政府欲统一天下，视少林为大患，设法去铲除它。 清政府藉天地会首脑陈近南藏身少林寺，趁机派大量官兵及高手消灭少林，寺内僧人四散，少林寺毁于火海。至善禅师自焚之前，嘱咐俗家弟子洪熙官及方世玉一定要重建少林寺。 洪、方二人访寻昔日同门胡惠乾，欲暗杀少林叛徒高进忠以报仇，惜事败，世玉被白眉所伤，幸获两广总督曾必正之女曾玉媛所救。方、媛并暗订终生。 乾隆微服南巡，偶然下遇见玉媛，被其美貌所吸引，决定封媛为贵妃，但此时玉媛已怀有方之骨肉，媛父恐招惹灭门之祸，狠心杀女并嫁祸方世玉。 方世玉知悉玉媛身亡，屡次行刺乾隆，不遂，终被杀。 另一方面，胡惠乾为复兴少林，舍恬静生活前往报仇，失手逃亡。其妻王婉冰于危难中诞下麟儿，取名文定，幸得洪熙官照顾，胡一家团聚。 高进忠看上婉冰，故意折磨惠乾，胁迫冰下嫁。洞房之夜，婉冰趁进忠宿醉未醒欲杀之，惜事败，反被进忠一刀刺死。 婉冰香消玉殒，惠乾誓要报此血海深仇，后逃入京城，躲于敖坤府中为仆。惠乾利用高进忠、敖坤、曾必正的矛盾，使敖坤被斩。惜惠乾最终也性命不保，临终前托熙官抚养儿子文定。 洪熙官隐姓埋名，并将少林的虎鹤双形拳改良成功，成为民间易于掌握的洪拳，而文定也长大了。 十二年后，洪熙官乘开武馆之便，带文定到广州拜猴拳云四为师，并告以身世。文定从此努力练武。洪与文定连手，击毙高进忠和白眉。又击退众武师，替乾隆立功。乾隆最终允许洪的请求，重建少林。而洪拳、猴拳两家之长，均集中在胡惠乾的遗孤，即洪文定身上。
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该剧设定在《小丑回魂》的27年前，讲述小丑潘尼怀斯的起源故事。
