故事开始于华佗在试验麻醉散时不幸导致儿子沸儿死亡，之后，华佗和徒弟李当之在再次试验麻醉散时意外穿越到现代亳州。在现代亳州，他们遇到导游芍花，开始了一段奇妙的现代之旅，期间华佗运用针灸、刮痧等传统疗法治愈了多位患者。故事最后，华佗在魏武祠遇到曹操雕像时被召唤，与徒弟一起返回东汉时代。回到古代后，他们成功研制出曼陀罗麻醉散，而现代亳州则继续传承着华佗的医术精神。