地球即将被毁灭，妮姆芙、阿斯特雷亚纷纷死去……为了拯救世界，仅剩的伊卡洛斯带着樱井智树飞往天空之城--西纳普斯。美丽的空中，伊卡洛斯回想起过去的日子……和主人在一起的时光，每一天、每一分、每一秒 这世上存在着一个选择将法律无法制裁的此世之恶作为恶性肿瘤“去除”，并将其埋葬于黑暗中的秘密组织，其名为“黑色标签”。17岁的高中生·三神岚，作为组织的一员，面对巨大的罪恶挺身而出。这个故事，是以高中生之身担当处刑人的少年，与选择和觉悟斗争的记录。 故事设定在一个身怀魔力的人类濒临灭绝的世界，武力的最高境界从使用利剑，转而到使用魔法，继而变成了使用枪械。就读于培训用以取缔残存魔力威胁的“异端审问官”专业机关——“对魔导学园”的男主角草薙哮，是个完 沉淀了历史浓厚气息的京都伏见，生活着一个有些鲁莽但十分单纯的女孩伏见稻荷（大空直美 配音）。她从小在供奉着狐仙的稻禾神社玩耍，对这里有着深深的羁绊。稻荷偷偷喜欢同班的帅气男孩丹波桥红司（冈本宽志 配音 伴随着“空间震”这一前所未有的灾害，出现了一些称为“精灵”的神秘少女，对于拥有压倒性力量、被称为灾难的她们，数十年间，人类从未停止对抗她们的步伐。 人类通常采取的措施是用武力来歼灭她们，或者是—— 世界受“魔甲虫”威胁，大地遭其占据，人类如今只能住在天空中的浮游都市里。人类当中诞生出以魔力对抗“魔甲虫”的魔法师——空战魔导士。就读空战魔导士培育机构——学园浮游都市“密斯特岗”的彼方·英司，是被冠 
