本剧是1987～1992年香港亚洲电视公司根据正史与民间野史编写的剧集，动员了亚洲电视台的大部份艺员参与拍摄。该剧不但在香港造成了收视热潮，也在香港以外的地区受到相当程度的欢迎。剧名《满清十三皇朝》，源自民国八年（1919年）由“燕北老人”所著《满清十三皇朝秘史》。二者描写的俱为努尔哈赤建立的后金国与清朝共十二位皇帝。（包含十一代，同治帝和光绪帝为堂兄弟）。燕北老人因为皇太极（清太宗）将国号由“金”改“清”，年号亦由天聪改为崇德，算两个皇朝。故称之为“满清十三皇朝”。
本剧改编自同名漫画，分两季播出，讲述了性格坦率温柔的高中生木下仁菜子（福本莉子 饰），在还未体会过“恋爱”这种感情的状态下，日复一日地过着平静的生活。某天，在放学回家的电车上，她与同班同学一之濑莲（高桥恭平 饰）相遇，渐渐被莲隐藏在心底的温柔所吸引。仁菜子内心像是被什么刺中了一般感到痛苦难耐，但她对莲的思念也一天天不断加深……终于，意识到这份情感就是“恋爱”的仁菜子，下定决心向莲表达了自己的心意，然而——
故事发生在日本的昭和时代，有森樱子（宫崎葵 饰）出生在一个普通的家庭之中。樱子自幼失去了母亲，由身为地质学家的父亲源一郎（三浦友和 饰）一手拉扯长大。樱子上面有两个姐姐笛子（北乃纪伊 饰）和杏子（尾崎千瑛 饰），两个女孩因为这个家庭早早失去了母亲而过早的肩负起了重任，因此性格有些强势，在强硬的姐姐们面前，性子软弱的樱子难免显得有些唯唯诺诺摇摆不定。实际上，樱子的心里一直埋藏着一个音乐梦想，她想成为一名钢琴家，可是，彼时的日本刚刚遭受战争的蹂躏，一片破败颓靡的景象，在残酷的现实面前，樱子不得不选择退让。
1945年，艰苦卓绝的抗日战争取得伟大胜利，中国在和平与战争、光明与黑暗等重大问题上，面临艰难抉择。以毛泽东、周恩来、朱德、刘少奇为首的中国共产党人，以人民为中心，与以蒋介石为首的国民党独裁者展开大决战。毛泽东以大无畏气概，孤身涉险赴重庆谈判，指挥解放军抢占东北、转战陕北、发起三大战役、进行土地革命，发布“五一口号”。中国共产党的政策，赢得广大人民群众和民主党派的欢迎拥护，最终战胜了蒋介石王朝。1949年10月1日，中华人民共和国宣告成立。
少年符生不谙世事，唯独痴迷医学，非常规的行医手段让城中百姓对他又爱又怕。一桩突如其来的“百医之死”案，不仅令他痛失父亲，更使他蒙上弑父凶手的污名。绝境之中，幸得前来寻医的西川郡主文珏与仗义游侠顾天出手搭救，这才死里逃生。为报救命之恩，符生答应随文珏前往西川救治其父。而在整理父亲遗物时，符生意外发现一个秘密，原来这世间竟藏有一件关乎社稷安稳之物——天书宝藏。百医惨死之局，正是因它而起。更令他心惊的是，宝藏所藏之地，正指向西川；而开启一切的钥匙，竟就在自己手中。为查明真相、也为守护百姓安宁，符生与文珏、顾天并肩踏上寻找“天书”的险途。谜案环环相扣，奇诡之事接连不断，三人在这热血与阴谋交织的旅途中步步为营。然而符生并不知道，他这一步步入局，已在西川城中掀起暗涌波澜……
