"高中生侦探工藤新一，被称为“日本警察的救世主”、“平成年代的福尔摩斯”。一次在与青梅竹马的女友毛利兰去游乐园游玩时，发现两个行动诡异的黑衣人。新一跟踪他们直到交易现场，另一个黑衣人趁其不注意从后面将他一棒击倒，并灌下一种名为APTX4869的神秘毒药企图杀他灭口，但因为副作用他的身体竟回到发育期的孩童状态。考虑到要是黑衣人知道他还活着的话，必将使周围的亲朋好友受到牵连，于是新一化名为“江户川柯南”，寄住在毛利兰的家中，想借助其父亲、担任侦探的毛利小五郎的力量来找寻黑衣人。
代表作为《攻壳机动队》等系列神作的神山健治正式公开了他最新一部作品的题目——《Xi AVANT》，并在2月25日的电影《攻壳机动队 S.A.C SSS 3D》的试映会上进行发表，将会以动画短篇的形式公开。本作的题目“Xi”取自2010年12月24日开始正式运行，由著名手机公司docomo提供的次时代通信LTE服务的概念名。docomo以这次通信服务为契机，建立了一个以世界为目标的名为“Xi PROJECT”的企划案，并请来长期活跃与广告与艺术领域的艺术创作家秋山具义和世界瞩目的著名动画监督神山健治强强联手，为这个次时代企划的推进献一份力。
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第四次非核大战一年后的2027 年，在还留有战争痕迹的新滨市，发生一起疑似收贿的军人遭到枪杀的案件。雨幕中，公安‧荒卷大辅为了找寻军人的电子脑而潜入墓地，却遭到想证明上司清白的草薙素子持枪抵住身后。但是，追查这起案件的并非只有草薙一人，拥有「不眠之眼」的巴特怀疑她就是爆破杀伤事件的犯人，因而紧咬着不放；以及正持续追查枪击案与娼妓命案间共通点的新滨县的刑警‧德古沙。此外，「501 机关」的徕津中佐也正注视着草薙的行动。为了寻找自身的未来与理想，草薙的本能将自此觉醒（ARISE）……。
《坂本日常》再度登场，迎来新战斗、新危机，还有更多的肉包。
